新冠肺炎疫情发生后,新型冠状病毒究竟从哪里来,一直是大家关心的问题。2月7日凌晨1点多,华南农业大学发布消息,称发现穿山甲为新型冠状病毒潜在中间宿主,引发各界关注。
7日上午11时,华南农业大学举行新闻发布会,详细介绍了该最新研究。
每日经济新闻(微信号:nbdnews)记者在发布会上了解到,相关攻关团队通过分析1000多份宏基因组样品,锁定穿山甲为潜在中间宿主,进而发现穿山甲中β冠状病毒的阳性率为70%;且病毒在电镜下观察到典型的冠状病毒颗粒结构;此外,基因组分析还发现,分离的病毒株与目前感染人的毒株序列相似度高达99%。“这些结果表明穿山甲为新型冠状病毒的潜在中间宿主。”
不过需要明确,上述实验的样品并非来自华南海鲜市场;同时,目前的研究也还未发现穿山甲与人的传播途径。
华南农大:穿山甲系潜在中间宿主
2月7日上午,每日经济新闻记者在发布会上获悉,岭南现代农业科学与技术广东省实验室、华南农业大学教授沈永义、肖立华等科研人员通过联合攻关,在新型冠状病毒潜在中间宿主的溯源上取得重大突破。他们的最新研究表明穿山甲为新型冠状病毒的潜在中间宿主。
发布会上,沈永义解释称,就像SARS的源头来自蝙蝠,但蝙蝠的SARS的病毒并不是直接感染人,而是通过果子狸这一类的小型肉食动物感染人,“这次新冠病毒目前的研究结果来自蝙蝠,但是这次武汉疫情爆发是在冬季,冬季蝙蝠是在冬眠状态的,直接感染人微乎其微,这中间需要一个‘桥梁’作用的中间宿主。”
从穿山甲中分离的新型冠状病毒电镜照片 图片来源:华南农业大学
沈永义及其团队的研究发现,对于新冠病毒而言,穿山甲有可能就是这个“桥梁”。
据介绍,攻关团队通过分析1000多份宏基因组样品,锁定穿山甲为新型冠状病毒的潜在中间宿主;继而通过分子生物学检测,揭示穿山甲中β冠状病毒的阳性率为70%;进一步对病毒进行分离鉴定,电镜下观察到典型的冠状病毒颗粒结构;最后通过对病毒的基因组分析,发现分离的病毒株与目前感染人的毒株序列相似度高达99%。
上述科研结果表明,穿山甲为新型冠状病毒的潜在中间宿主。
据沈永义介绍,这一最新发现将有利阻断病毒动物源,避免病原的长期传播,对新型冠状病毒的源头防控具有重大意义,“中间宿主相当于传染源的源头,如果这个源头没控制住,后面各种防护做得再好,还是会从这个源头不断扩散出来,使得疫情控制出现反复”。
尚未明确传播路径
不过需要注意的是,记者在发布会上了解到,此次实验样本的穿山甲,并不是来自武汉华南海鲜市场。
“找了我国市场上常见的野生动物进行检测,发现穿山甲携带的病毒与人的关系比较近。”沈永义在发布会后的媒体采访环节中如是解释。
发布会上,相关专家在介绍科研过程 每经记者 吴泽鹏 摄
华农教授冯耀宇在媒体采环节中也表示,“我们说的发现中间宿主,并不意味着这一中间宿主来自华南海鲜市场,我们只是揭示可能的中间宿主。”“我们是对现在数据库有的宏基因组进行分析,从中寻找哪一种有可能与目前发现的病毒相似性很高,从这当中发现了穿山甲。发现了后再做回溯,回溯样品发现与这个很像的,并不是从华南海鲜市场获得的样品。”“我们并没有大规模获得很多的穿山甲,样品量并不是特别大。”
同时,目前尚未明确穿山甲如何传播至人,“我们后期还需要做更多的工作,究竟如何从中间宿主传给人。”沈永义说。
“鉴于当前疫情防控的严峻性,我们选择将研究结果在第一时间向社会公布,希望有助于疫情的科学防控,并为更多科学家开展进一步工作提供借鉴。”岭南现代农业科学与技术广东省实验室常务副主任、华南农业大学校长刘雅红教授表示。
什么是“中间宿主”
“宿主”也称为“寄生”,是指寄生物所寄生的生物。病毒不能自己独立生存。
从字面来看,“宿”的意思是“住宿、住所”,“主”就是主人的意思,两个字的意思就是为外来的客人提供住所和一切招待的人(如食物或其他客人需要的物资),也就类似于“客栈老板”。
在此次新型病毒感染中,新型病毒是外来的“客人”,为病毒提供“食物和所需物资”的生物就是“宿主”。
自然宿主则是指除人以外,自然界中为寄生物提供营养和场所的生物。
中间宿主就是处于中间阶段的宿主,它也能为寄生物提供营养和保护,但是暂时性的。中间宿主常常作为媒介,将寄生物“运输”到“终点站”,即最终宿主。
穿山甲 图片来源:摄图网
在此次武汉肺炎中,野生动物是“中间宿主”,是传播病毒的媒介,而人类似乎是病毒的“终点站”,类似于“最终宿主”,因为暂时科学家还没有发现病毒可以由人再传给其他动物的证据。
此前,钟南山在接受新华社采访时表示,对新型冠状病毒(2019-nCoV)的基因组的分析研究表明,其与SARS-CoV有79.5%的相似性,而与蝙蝠来源CoV有96%的相似性,基本支持2019-nCoV来源于蝙蝠,但是否存在中间宿主目前还需要研究。
1月23日,中国科学院武汉病毒研究所石正丽团队发布最新研究成果:武汉新型冠状病毒在整个基因组水平上与蝙蝠冠状病毒的同源性为96%,这意味着新型冠状病毒很可能来源于蝙蝠。
据红星新闻报道,石正丽表示,新型冠状病毒可能与当年的SARS病毒一样,其自然宿主都来自蝙蝠。对于该病毒如何传染给人类,她介绍,还存在一个中间宿主,但该中间宿主是什么还不知道。
“因为蝙蝠对于人类来说是不容易接触的,这么大面积传播是不可能的,一定是通过一个高密度养殖的动物传播的。”石正丽表示。
相关报道:中间宿主可能是穿山甲?知乎大V:靠谱,而且可能是东南亚的穿山甲
从常理来看,动物越接近,病毒越共享,毕竟动物在分类上越接近,越意味着他们本身相似度高,基因相似度,细胞受体相似度都高,那么对于病毒来说,越容易感染。穿山甲,属于哺乳动物,这一点要更靠谱。
来源:腾讯科技&知乎
据媒体报道,华南农业大学、岭南现代农业科学与技术广东省实验室教授沈永义、肖立华等科研人员,通过联合攻关,在新型冠状病毒潜在中间宿主的溯源上取得突破。他们的最新研究表明,穿山甲为新型冠状病毒的潜在中间宿主。
据了解,攻关团队通过分析1000多份宏基因组样品,锁定穿山甲为新型冠状病毒的潜在中间宿主;继而通过分子生物学检测,揭示穿山甲中β冠状病毒的阳性率为70%;进一步对病毒进行分离鉴定,电镜下观察到典型的冠状病毒颗粒结构;最后通过对病毒的基因组分析,发现分离的病毒株与目前感染人的毒株序列相似度高达99%。
对于这一发现,知乎答主、中国科学院遗传学在读博士李雷认为,穿山甲是中间宿主的可能性要大于之前有人猜测的蛇,毕竟穿山甲属于哺乳动物。
以下为知乎答主、中国科学院遗传学在读博士李雷撰文全文,腾讯科技稍作整理:
本文的核心内容来源于一篇名为《nCoV-2019 Spike Protein Receptor Binding Domain Shares High Amino Acid Identity With a Coronavirus Recovered from a Pangolin Viral Metagenomic Dataset》的论文,题目的意思是:通过对新型冠状病毒的spike蛋白受体结构域分析,发现新型冠状病毒的相似度和马来亚穿山甲病毒多样性的数据集十分相似。
首先,什么是spike蛋白?冠状病毒为啥叫“冠状”病毒?其实就是因为它表面有一堆凸起的东西,就像帽子(冠)一样,所以才叫冠状病毒,而这个冠,就是spike蛋白(英文意思是尖、突)。
这是新型冠状病毒电镜下的照片:
这是冠状病毒包膜上的一个刺突糖蛋白(S,Spike Protein),也就是大家目前认为病毒能够感染人的重要因素,这个蛋白的作用是识别并结合宿主细胞表面受体血管紧张素转化酶Ⅱ(ACEⅡ),从而介导病毒包膜与细胞膜融合。
比如当年SARS病毒就是通过s蛋白去结合人体的ACEⅡ相互作用而入侵人体的。目前各大机构对于新型冠状病毒的感染机制仍主要集中在这个s蛋白上。
通俗的理解就是:有了这家伙,病毒才能抓住细胞,否则就是滑不溜的粘不住,那自然也无法入侵了。所以,这篇研究就把目光瞄准了s蛋白,他们选择的是s蛋白的保守性。
之前,武汉病毒所的石正丽团队通过序列比对,认为病毒是来自于蝙蝠RaTG13 genome。作者比较石正丽研究员的文章时候发现,尽管这次病毒和蝙蝠相似度极高,高达96% 。
但是,spike病毒这个关键的东西结构域(S1 Receptor Binding Domain (RBD))却明显的不一样,尤其是在第350-530氨基酸序列,相似度仅有91%。
这么大差异,直接从蝙蝠到人身上,那难度太高了,毕竟相差太远,病毒感染也为难。一定有个中间宿主在发挥作用,让整个病毒在中间宿主上继续发生进化,直到其更容易感染人类。事实上,中间宿主是蝙蝠感染的常见历史,SARS、MERS等病毒都是蝙蝠通过中间宿主感染了人,所以这次大家也纷纷寻找新型冠状病毒的中间宿主。
论文作者决定去寻找一个更加接近的中间宿主,依靠的办法是生物信息学。他们把这次新型冠状病毒的序列丢到公共数据库上进行寻找,结果意外发现,这段序列,竟然和穿山甲的病毒库最像,高达97%的相似度,远超过和蝙蝠91%的相似度。
这个数据库是最近才发表的Malayan pangolins病毒数据库(PRJNA573298106)。这是截至目前为止,这段核心序列最高的比对率,大家可以理解为相似度——97%。
Malayan pangolins是什么?答案是,马来穿山甲。
这个结论可靠吗?
1、比蛇更可靠,因为穿山甲是哺乳动物。
之前有人认为是蛇,当然这个我认为是不可信的。从常理来看,动物越接近,病毒越共享,毕竟动物在分类上越接近,越意味着他们本身相似度高,基因相似度,细胞受体相似度都高,那么对于病毒来说,越容易感染,比如猩猩和人类共享的艾滋病毒HIV,绿猴和人类共享的马尔堡病毒、埃博拉病毒。
穿山甲,属于哺乳动物,这一点要更靠谱。
2、马来穿山甲会来到中国吗?
马来穿山甲,这本来是一种生活在东南亚的穿山甲,但是当中国人把自己土生土长的“中华穿山甲”吃光后,马来穿山甲也成了中国人的热宠。
据媒体于2018年12月19日报道,南宁海关自2016年以来截获穿山甲共2578只,主要是马来穿山甲。
其实,走私穿山甲早已经是公开的秘密了,由于紧挨中国,生活在的东南亚的马来亚穿山甲,已经成为了部分中国人的新热宠。